图注：翼龙的形态演化速率在树上的变化，图片来自古脊所公号
翼龙演化的兴盛期始于三叠纪时期，这个过程中翼龙的形态学多样性和形态演化速率都较高，其中出现在晚三叠世的辐射以前肢肩带演化速率增加为标志，显示翼龙即将完全占据天空生态系统的统治权，早白垩世的辐射则明显开始大型化，包括体型的增大和头冠多样性上升。
图注：翼龙头冠多样性，图片来自网络
在侏罗纪与白垩纪交界时期，小型翼龙数量明显减少，鸟类数量则开始上升，并且有可能在竞争中排挤了大部分的小型翼龙。之后翼龙便进入了衰亡期，无论是多样性还是演化速率都不断下降，仅有大型化的成员生存到了大灭绝，不过近期的研究显示到白垩纪末期依然有少数的小型翼龙存在，比如在《史前星球》中出场的翠鸟翼龙（Alcione）。
图注：翼龙的体型演化，来自古脊所公号
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